分类
按年度分类：将档案按其形成的年度分开，不同年度的档案分别整理。这种方法适用于大多数档案，能保持档案在时间上的连续性。
按机构分类：按照档案形成的机构或部门进行分类，便于查找和利用与特定机构相关的档案。
按问题分类：根据档案所反映的主题或问题进行分类，能集中反映某一特定问题的相关档案。
按保管期限分类：将档案按规定的保管期限进行分类，如、长期、短期，以便于档案的鉴定和销毁。
实际操作中，通常采用复式分类法，如年度 - 机构、年度 - 问题等组合方式。
编号
档号编制：给每个档案或档案盒编制的档号，档号应包含分类号、年度、案卷号等信息，例如 “XZ - 2023 - 001”，其中 “XZ” 表示行政档案，“2023” 是年度，“001” 是案卷号。
编号标识：在档案盒或档案上清晰地标注档号，可使用标签或直接打印在档案盒上，确保编号醒目、易于识别。
全宗原则：全宗是一个独立的机关、组织或个人在社会活动中形成的全部档案的有机整体。档案整理要维护全宗的完整性，即同一全宗的档案不可分散，不同全宗的档案不得混淆。这有助于保持档案之间的内在联系，反映一个特定主体的活动全貌。比如，某企业的档案构成一个全宗，其各个部门、各个时期形成的档案都应归属于这个全宗，不能将该企业的档案与其他企业的档案混在一起整理。
按文件间的关联分类
系列文件分类：对于具有连续性、关联性的系列文件，如会议文件，可将会议通知、议程、报告、决议等按会议的先后顺序整理成一个系列，体现会议的完整过程和决策形成的脉络。
文件组合分类：将在内容上相互补充、相互印证的文件组合在一起。例如，一份政策文件与其相关的实施细则、解释说明、执行情况报告等组合分类，能更、深入地反映政策的制定和执行情况。